Para visualizar a un tamaño adecuado, por favor hacer click con el botón derecho del mouse y salvar el archivo.
Nota: el examen de reparación será el día 15/03/2013 a las 9:00 en el Departamento de Biología
miércoles, 13 de marzo de 2013
NOTAS INTERSEMESTRALES II 2012
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Nota: el examen de reparación será el día 15/03/2013 a las 9:00 en el Departamento de Biología
lunes, 18 de febrero de 2013
Cuestionario para exposiciones días 04 y 05/03/2013
Listado de preguntas (organizadas de acuerdo al número del grupo establecido en clases):
Nota: Por cada pregunta, preparar una introducción, que incluya definición del grupo taxonómico en cuestión y sus relaciones evolutivas; luego un desarrollo, esto es, la respuesta como tal a la pregunta, y por último unas conclusiones de los aspectos más resaltantes
1.
Importancia de las endosimbiosis secundaria en
la generación de la diversidad evolutiva de las algas
2.
Importancia clínica de Diplomonadida
3.
Importancia de las amibas comensales principales
en el humano
4.
Aplicación geológica del estudio de los
radiolarios Polycystina
5.
Importancia clínica de Kinetoplastida
6.
Mareas rojas
7.
Importancia clínica de Apicomplexa
8.
Importancia evolutiva de Archaeplastida
9.
Importancia económica de Peronosporomycetes
10.
Importancia económica de las micorrizas
Nota: Por cada pregunta, preparar una introducción, que incluya definición del grupo taxonómico en cuestión y sus relaciones evolutivas; luego un desarrollo, esto es, la respuesta como tal a la pregunta, y por último unas conclusiones de los aspectos más resaltantes
martes, 3 de mayo de 2011
El "árbol de la vida" ... ¿o es un bosque?
Durante la Semana Aniversario del Departamento de Biología de la Universidad de Oriente, cuando conmemoramos los 51 años de funcionamiento de nuestro Departamento, ofrecimos una conferencia sobre la filogenia universal de todos los organismos o "árbol de la vida", como parte de un mini simposio sobre lo que es la evolución 150 años después de la publicación de "El Origen de las Especies".
En esta entrada hago disponible el archivo en formato powerpoint de la presentación para su descarga, así como algunas referencias que son importantes. Otras referencias son citadas en la presentación y muchas otras están disponibles bajo pedido. Pueden enviarme un email o directamente en la Universidad.
También he colocado el link para la descarga de la publicación del Prof. Julio Pérez en que se basó su ponencia.
Espero que descarguen, lean y discutan todo este material.
Archivos para descarga:
presentación (diapositivas en powerpoint)
Referencias:
Bapteste, E. et al. 2009. Prokaryotic evolution and the tree of life are two different things. Biol. Dir. 4: 34.
Boto, L. 2010. Horizontal gene transfer in evolution: facts and challenges. Proc. R. Soc. B 277: 819-827.
Cavalier-Smith, T. 2010. Deep phylogeny, ancestral groups and the four ages of life. Phil. Trans. R. Soc. B 365: 111-132.
Goldenfeld, N. y Woese, C. 2007. Biology´s next revolution. Nature 445: 25.
Keeling, P. y Palmer, J. 2008. Horizontal gene transfer in eukaryotic evolution. Nature Rev. Gen. 9: 605-618.
Lawton, G. 2009. Uprooting Darwin´s tree. New Scientist 24 jan 2009: 34-39.
PUBLICACIÓN DEL PROF. JULIO PÉREZ:
Perez, et al. 2010. Towards a new evolutionary theory. Interciencia 35: 862-868
En esta entrada hago disponible el archivo en formato powerpoint de la presentación para su descarga, así como algunas referencias que son importantes. Otras referencias son citadas en la presentación y muchas otras están disponibles bajo pedido. Pueden enviarme un email o directamente en la Universidad.
También he colocado el link para la descarga de la publicación del Prof. Julio Pérez en que se basó su ponencia.
Espero que descarguen, lean y discutan todo este material.
Archivos para descarga:
presentación (diapositivas en powerpoint)
Referencias:
Bapteste, E. et al. 2009. Prokaryotic evolution and the tree of life are two different things. Biol. Dir. 4: 34.
Boto, L. 2010. Horizontal gene transfer in evolution: facts and challenges. Proc. R. Soc. B 277: 819-827.
Cavalier-Smith, T. 2010. Deep phylogeny, ancestral groups and the four ages of life. Phil. Trans. R. Soc. B 365: 111-132.
Goldenfeld, N. y Woese, C. 2007. Biology´s next revolution. Nature 445: 25.
Keeling, P. y Palmer, J. 2008. Horizontal gene transfer in eukaryotic evolution. Nature Rev. Gen. 9: 605-618.
Lawton, G. 2009. Uprooting Darwin´s tree. New Scientist 24 jan 2009: 34-39.
PUBLICACIÓN DEL PROF. JULIO PÉREZ:
Perez, et al. 2010. Towards a new evolutionary theory. Interciencia 35: 862-868
viernes, 22 de octubre de 2010
Diapositivas de las clases teóricas
Los siguientes enlaces permiten la descarga de las diapositivas y lecturas que se verán en cada una de las clases (en formato ".pptx" y ".pdf" respectivamente)
- Núcleo Temático 1. Uniformidad de la vida
diapositivas
lectura
- Núcleo Temático 2. Origen y diversificación temprana de la vida
diapositivas
lectura
- Núcleo Temático 3. Dominios procariontes
diapositivas
lectura
- Núcleo Temático 4. Dominio eucarionte
diapositivas (1)
diapositivas (2)
diapositivas (3)
diapositivas (4) Amoebozoa
diapositivas (5) Rhizaria
diapositivas (6) Excavata
diapositivas (7) Archaeplastida
diapositivas (8) Chromalveolata
- Núcleo Temático 1. Uniformidad de la vida
diapositivas
lectura
- Núcleo Temático 2. Origen y diversificación temprana de la vida
diapositivas
lectura
- Núcleo Temático 3. Dominios procariontes
diapositivas
lectura
- Núcleo Temático 4. Dominio eucarionte
diapositivas (1)
diapositivas (2)
diapositivas (3)
diapositivas (4) Amoebozoa
diapositivas (5) Rhizaria
diapositivas (6) Excavata
diapositivas (7) Archaeplastida
diapositivas (8) Chromalveolata
Contenido Programático
descargar programa analítico completo
La finalidad de esta materia es introducir al estudiante de biología en la enorme diversidad que supone la vida, con énfasis en los organismos unicelulares o multicelulares simples, que luego no son cubiertos de una forma más profunda por asignaturas posteriores, como las botánicas, zoologías y microbiología general.
Para entender esta diversidad primero se establecen las bases moleculares y celulares que unifican a todos los seres vivos (Núcleo Temático 1) y se discuten algunas de las hipótesis más modernas sobre cómo se cree que se originó la vida en nuestro planeta (Núcleo Temático 2).
Luego se hace un paseo por los distintos linajes principales del árbol universal de la vida, comenzando con una introducción a los organismos procariontes (Núcleo Temático 3) y terminando con una revisión un poco más profunda de los organismos eucariontes (Núcleo Temático 4), incluyendo una discusión de sus características celulares básicas y de algunos procesos fundamentales, así como una revisión de la evolución y diversidad de estos organismos, tomando como base la clasificación filogenética moderna en cinco a seis "supergrupos".
A continuación se desglosa cada uno de los cuatro núcleos temáticos en que consiste la asignatura Biología de Organismos. El programa analítico oficial puede ser descargado aquí.
NÚCLEO TEMÁTICO 1: Uniformidad de la vida
- Todos los seres vivos comparten una misma base molecular y celular
- La vida puede ser definida sobre la base de cinco propiedades
fundamentales
- Todos los seres vivos tienen una misma unidad de organización básica –
la célula
- Todos los seres vivos son formados por compuestos de carbono
- Todas las células usan el mismo tipo de molécula para almacenar su
información hereditaria (ADN)
- En la replicación de la información hereditaria las bandas de las
moléculas de ADN pre-existentes funcionan como molde para las nuevas
bandas
- En todas las células la información hereditaria es transcrita a una misma
molécula intermediaria (ARN)
- Todas las células usan el mismo lenguaje universal para traducir la
información hereditaria de ARN a proteínas
- Todas las células usan proteínas como catalizadores
- Todas las células requieren energía libre.
NÚCLEO TEMÁTICO 2: Origen y diversificación temprana de la vida
- La vida ha estado presente en el Planeta desde épocas muy remotas
- La Tierra se formó a través de un violento proceso de acreción
- Las condiciones de la Tierra primitiva eran completamente diferentes a las actuales
- Es probable que la vida se haya originado espontáneamente en la Tierra
primitiva
- Los fósiles celulares más antiguos que se conocen son de organismos
procariontes
- La vida se diversificó tempranamente en tres linajes evolutivos
principales: Eubacterias, Arqueobacterias y Eucariontes.
NÚCLEO TEMÁTICO 3: Dominios procariontes (Eubacteria y Archaebacteria)
- Dos de los dominios filogenéticos fundamentales de la vida consisten de
organismos formados por células procariontes
- Las células procariontes son estructuralmente simples
- La estructura de las células procariontes fue explorada a plenitud con el
microscopio electrónico de transmisión
- Los organismos procariontes viven casi siempre como células aisladas
(unicelulares)
- Los procariontes son los organismos fisiológicamente más diversos
- Los procariontes son organismos sumamente abundantes en el planeta
- Los procariontes son organismos fundamentales para el funcionamiento
de la biosfera y para las sociedades humanas
- Dominio Eubacteria:
- Características básicas
- Ejemplo: Cianobacterias
- Dominio Archaeobacteria:
- Características básicas.
NÚCLEO TEMÁTICO 4: Dominio eucarionte (Eucarya)
- Características generales de las células eucariontes
- Los eucariontes son los organismos constituidos por células con núcleo
- Las células eucariontes presentan una gran compartimentación a través de biomembranas independientes topológicamente de la membrana plasmática
- Principales componentes del citoplasma eucarionte: citosol, ribosomas 80S, citoesqueleto, etc.
- Principales organelos de membrana eucariontes: retículo endoplasmático, aparato de Golgi, mitocondrias, plastidios, vacuolas, lisosomas
- Estructura y funciones del núcleo eucarionte, características básicas del genoma eucarionte
- Flagelos y cilios, estructura general y funciones
- Algunos procesos fundamentales en las células eucariontes
- Transporte celular a través de la membrana plasmática
- Ciclo celular
- Mitosis y meiosis
- Reproducción sexual y ciclos de vida
- Tipos de nutrición en eucariontes
- Relaciones simbióticas
- Evolución y diversidad de los organismos eucariontes
- Fósiles eucariontes más antiguos
- Relaciones filogenéticas de los eucariontes: árbol universal de tres dominios versus ‘árbol eocito’
- Puntos clave en la evolución general de la célula eucarionte a partir de una célula procarionte
- Endosimbiosis y origen de las mitocondrias y plastidios
- Clasificación de la diversidad eucarionte: sistemas de reinos tradicionales versus sistema moderno de supergrupos filogenéticos
- Supergrupo Amoebozoa: definición, características generales del grupo, nutrición y ecología, ejemplos: Amoeba proteus, Arcella, Difflugia, Entamoeba, Acanthamoeba, Dictyostelium y Myxogástridos
- Supergrupo Rhizaria: definición, características generales del grupo, ejemplos: Foraminíferos y radiolarios
- Supergrupo Excavata: definición, características generales,
ejemplos: Giardia, Trichomonas, Euglenozoos: euglénidos y kinetoplástidos
- Supergrupo Archaeplastida: definición, endosimbiosis primaria y origen de los plastidios primarios, características generales, diversidad y ejemplos: Cyanophora paradoxa, Rhodophyceae y Chloroplastida
- Supergrupo Chromalveolata: definición, endosimbiosis secundaria y origen de los plastidios secundarios en cromalveolados, características generales del plastidio de Cryptomonas como modelo, ejemplos: Estramenópilos, definición y ejemplos: Peronosporomicetos, diatomeas y algas paras; Alveolados, definición y ejemplos: ciliados, dinoflagelados y apicomplejos
- Supergrupo Opisthokonta: definición, características generales, diversidad y ejemplos: hongos: definición y ejemplos: Zygomycota, Ascomycota y Basidiomycota
La finalidad de esta materia es introducir al estudiante de biología en la enorme diversidad que supone la vida, con énfasis en los organismos unicelulares o multicelulares simples, que luego no son cubiertos de una forma más profunda por asignaturas posteriores, como las botánicas, zoologías y microbiología general.
Para entender esta diversidad primero se establecen las bases moleculares y celulares que unifican a todos los seres vivos (Núcleo Temático 1) y se discuten algunas de las hipótesis más modernas sobre cómo se cree que se originó la vida en nuestro planeta (Núcleo Temático 2).
Luego se hace un paseo por los distintos linajes principales del árbol universal de la vida, comenzando con una introducción a los organismos procariontes (Núcleo Temático 3) y terminando con una revisión un poco más profunda de los organismos eucariontes (Núcleo Temático 4), incluyendo una discusión de sus características celulares básicas y de algunos procesos fundamentales, así como una revisión de la evolución y diversidad de estos organismos, tomando como base la clasificación filogenética moderna en cinco a seis "supergrupos".
A continuación se desglosa cada uno de los cuatro núcleos temáticos en que consiste la asignatura Biología de Organismos. El programa analítico oficial puede ser descargado aquí.
NÚCLEO TEMÁTICO 1: Uniformidad de la vida
- Todos los seres vivos comparten una misma base molecular y celular
- La vida puede ser definida sobre la base de cinco propiedades
fundamentales
- Todos los seres vivos tienen una misma unidad de organización básica –
la célula
- Todos los seres vivos son formados por compuestos de carbono
- Todas las células usan el mismo tipo de molécula para almacenar su
información hereditaria (ADN)
- En la replicación de la información hereditaria las bandas de las
moléculas de ADN pre-existentes funcionan como molde para las nuevas
bandas
- En todas las células la información hereditaria es transcrita a una misma
molécula intermediaria (ARN)
- Todas las células usan el mismo lenguaje universal para traducir la
información hereditaria de ARN a proteínas
- Todas las células usan proteínas como catalizadores
- Todas las células requieren energía libre.
NÚCLEO TEMÁTICO 2: Origen y diversificación temprana de la vida
- La vida ha estado presente en el Planeta desde épocas muy remotas
- La Tierra se formó a través de un violento proceso de acreción
- Las condiciones de la Tierra primitiva eran completamente diferentes a las actuales
- Es probable que la vida se haya originado espontáneamente en la Tierra
primitiva
- Los fósiles celulares más antiguos que se conocen son de organismos
procariontes
- La vida se diversificó tempranamente en tres linajes evolutivos
principales: Eubacterias, Arqueobacterias y Eucariontes.
NÚCLEO TEMÁTICO 3: Dominios procariontes (Eubacteria y Archaebacteria)
- Dos de los dominios filogenéticos fundamentales de la vida consisten de
organismos formados por células procariontes
- Las células procariontes son estructuralmente simples
- La estructura de las células procariontes fue explorada a plenitud con el
microscopio electrónico de transmisión
- Los organismos procariontes viven casi siempre como células aisladas
(unicelulares)
- Los procariontes son los organismos fisiológicamente más diversos
- Los procariontes son organismos sumamente abundantes en el planeta
- Los procariontes son organismos fundamentales para el funcionamiento
de la biosfera y para las sociedades humanas
- Dominio Eubacteria:
- Características básicas
- Ejemplo: Cianobacterias
- Dominio Archaeobacteria:
- Características básicas.
NÚCLEO TEMÁTICO 4: Dominio eucarionte (Eucarya)
- Características generales de las células eucariontes
- Los eucariontes son los organismos constituidos por células con núcleo
- Las células eucariontes presentan una gran compartimentación a través de biomembranas independientes topológicamente de la membrana plasmática
- Principales componentes del citoplasma eucarionte: citosol, ribosomas 80S, citoesqueleto, etc.
- Principales organelos de membrana eucariontes: retículo endoplasmático, aparato de Golgi, mitocondrias, plastidios, vacuolas, lisosomas
- Estructura y funciones del núcleo eucarionte, características básicas del genoma eucarionte
- Flagelos y cilios, estructura general y funciones
- Algunos procesos fundamentales en las células eucariontes
- Transporte celular a través de la membrana plasmática
- Ciclo celular
- Mitosis y meiosis
- Reproducción sexual y ciclos de vida
- Tipos de nutrición en eucariontes
- Relaciones simbióticas
- Evolución y diversidad de los organismos eucariontes
- Fósiles eucariontes más antiguos
- Relaciones filogenéticas de los eucariontes: árbol universal de tres dominios versus ‘árbol eocito’
- Puntos clave en la evolución general de la célula eucarionte a partir de una célula procarionte
- Endosimbiosis y origen de las mitocondrias y plastidios
- Clasificación de la diversidad eucarionte: sistemas de reinos tradicionales versus sistema moderno de supergrupos filogenéticos
- Supergrupo Amoebozoa: definición, características generales del grupo, nutrición y ecología, ejemplos: Amoeba proteus, Arcella, Difflugia, Entamoeba, Acanthamoeba, Dictyostelium y Myxogástridos
- Supergrupo Rhizaria: definición, características generales del grupo, ejemplos: Foraminíferos y radiolarios
- Supergrupo Excavata: definición, características generales,
ejemplos: Giardia, Trichomonas, Euglenozoos: euglénidos y kinetoplástidos
- Supergrupo Archaeplastida: definición, endosimbiosis primaria y origen de los plastidios primarios, características generales, diversidad y ejemplos: Cyanophora paradoxa, Rhodophyceae y Chloroplastida
- Supergrupo Chromalveolata: definición, endosimbiosis secundaria y origen de los plastidios secundarios en cromalveolados, características generales del plastidio de Cryptomonas como modelo, ejemplos: Estramenópilos, definición y ejemplos: Peronosporomicetos, diatomeas y algas paras; Alveolados, definición y ejemplos: ciliados, dinoflagelados y apicomplejos
- Supergrupo Opisthokonta: definición, características generales, diversidad y ejemplos: hongos: definición y ejemplos: Zygomycota, Ascomycota y Basidiomycota
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